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发烫
当EB病毒发作时，除轻度病例外，还会出现发热，约38.5~40℃，无固定热。有的患者伴有畏寒、寒颤，热程不同，从几天到几周，有的患者持续2~4个月。发热减退伴有出汗。
淋巴肿大
70%的感染性单核细胞增多症患者会出现淋巴肿大，通常发生在疾病的第一周。浅表淋巴结受累广泛，颈部淋巴结较为常见。其次，腋窝和腹股沟，偶尔也会侵入胸部、纵隔和肠系膜淋巴结。直径1~4cm，强度中等，分散不粘，无明显压痛，无溃疡，两侧不同。肠系膜淋巴结受累时可出现腹痛等不适。
肝功能异常
EB病毒发作时，约三分之二的病例会引起肝功能异常，如谷丙转氨酶（ALT）上升时，也有部分患者会出现黄胆。
肝脾大
EB病毒发作时，约10%的患者肝大，多在肋下2厘米处。半数患者脾大轻微，有疼痛和压痛，脾破裂罕见。
咽峡炎
大约一半的患者咽部、扁桃体充血肿胀，少数溃疡或假膜，伴有咽痛，严重肿胀可引起呼吸不良或吞咽障碍。
其他罕见病
少数可引起神经系统症状，反映为急性无菌性脑炎、脑膜脑炎、脑干脑炎、周围神经炎等，偶尔见心包炎、心肌炎、肾炎或肺炎、腹泻等。
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