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牙结石的形成是从软垢开始，软垢是一种软的、无定型的沉积物，含有大量的细菌和渗出的白细胞、脱落上皮细胞、食物残留等。软垢若是在牙面沉积后，若不及时刷除，则可变成支架，有益于钙盐的沉积产生牙结石。
唾液里的二氧化碳逸出，病菌代谢和蛋白质分解产生的氨等可引起唾液中PH值上升，造成钙、磷等离子呈过饱和状态析出而出现沉积，在牙齿表面产生结石。
细菌和脱落上皮细胞释放的磷酸酶，可加速磷酸盐的沉积，在牙齿表面产生异物硬块而。
牙结石造成粘附与牙龈边缘的位置不同，而分成龈上结石和龈下结石。唾液中的钙、磷等碳酸盐类为龈上结石的主要来源，龈下结石则依赖于牙龈沟内渗出液中提供碳酸盐来源而产生牙石沉积。
牙结石产生速度有所不同，遭受唾液量、唾液成份、饮食、牙齿排序和口腔卫生习惯等的影响，在这些因素的综合作用下，使有些人不易产生牙结石，而有的人却容易出现牙结石。
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