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在新型甲型H1N1感冒病毒中，H代表血细胞凝集素，又称血凝素，能使病毒吸附在易患细胞表面；N代表神经氨酸酶。H和N都是糖蛋白。根据H和N抗原的不同，甲型流感病毒分为许多亚型，H可分为16个亚型（H1~H16），N可分为9个亚型（N1~N9），使甲型流感病毒有许多亚型（如H1N1）、H2N2、H3N3等。)，每个亚型的病毒性和传播速度都不一样，而且每个亚型之间没有交叉免疫力。其中H1N1、H2N2、H3N2亚型的关键感染了人们，许多其他亚型的自然宿主都是各种禽类和动物。新型甲型H1N1流感病毒株含有禽流感、猪流感和人流感三种感冒病毒的脱氧核糖核酸基因片段，具有亚洲猪流感和非洲猪流感病毒的特点。
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